El plan de estudios del doctorado se estructura curricularmente en Unidades de Aprendizaje (UA) que atienden a cuatro áreas: Matemática, Pedagógica, Investigación e Histórico-Epistemológica. El plan de estudios se constituye de 33 UA, con carácter de optativas 5 corresponden al área de Matemáticas, 17 a la Pedagógica, 8 a la de Investigación y 4 corresponden a la Histórico-Epistemológico. Cada UA cubre un total de 13 créditos por semestre (Tabla 3). Estas UA se programan para cada estudiante en función de las necesidades de formación y profundización que su tema de investigación requiere en el que se tiene en cuenta sus condiciones iniciales. Con base en ello, se establece por el director de tesis y el estudiante, un programa de actividades académicas semestrales (cursos, seminarios, estancias académicas). En los cursos articulados a las UA, debe involucrarse además del director de tesis, como mínimo, a dos investigadores expertos en las áreas a fin de garantizarle una adecuada formación como investigador. El director de tesis garantiza las condiciones para la realización de las actividades académicas contempladas en el programa semestral de actividades convenido.